Chiba/Flagella/Making FliC-his

From 2007.igem.org

(Difference between revisions)
Line 1: Line 1:
-
#pUC19 vectorにFliCをコードする遺伝子を挿入→pUC19-FliC(島田さんから)
+
#pUC19 vectorにFliCをコードする遺伝子を挿入→pUC19-FliC
-
#エキサイトPCR
+
#ExSite PCR
#design insert(ヒスチジンタグ)
#design insert(ヒスチジンタグ)
#pUC19-FliC vector とinsertオリゴをライゲーション.
#pUC19-FliC vector とinsertオリゴをライゲーション.
Line 6: Line 6:
-
*エキサイトPCR
+
*ExSite PCR
**design primer
**design primer
FliCの可変領域のうち、フィラメントの外側部分から5か所を選び、プライマーを設計(207,228,240,252,267)
FliCの可変領域のうち、フィラメントの外側部分から5か所を選び、プライマーを設計(207,228,240,252,267)
pUC19-FliCをpUC19-FliC-vectorに
pUC19-FliCをpUC19-FliC-vectorに
***[PCR表]
***[PCR表]
-
***[混ぜ表]
+
***[Reaction Conditions]
**Template 1μL
**Template 1μL
-
**Primer(FとR) 5μL
+
**Primer(Foward and Reverse) 5μL
**10×buffer 10μL
**10×buffer 10μL
**dNTPmix 10μL
**dNTPmix 10μL
Line 28: Line 28:
-
*pUC19-FliC vector とinsertオリゴをライゲーション.
+
*Ligation pUC19-FliC vector とinsertオリゴをライゲーション.
-
***[混ぜ表]
+
***[Reaction Conditions]
**insertオリゴ 2μL
**insertオリゴ 2μL
**pUC19-FliC vector 2μL
**pUC19-FliC vector 2μL

Revision as of 04:37, 27 October 2007

  1. pUC19 vectorにFliCをコードする遺伝子を挿入→pUC19-FliC
  2. ExSite PCR
  3. design insert(ヒスチジンタグ)
  4. pUC19-FliC vector とinsertオリゴをライゲーション.
  5. GelCheck


  • ExSite PCR
    • design primer

FliCの可変領域のうち、フィラメントの外側部分から5か所を選び、プライマーを設計(207,228,240,252,267) pUC19-FliCをpUC19-FliC-vectorに

      • [PCR表]
      • [Reaction Conditions]
    • Template 1μL
    • Primer(Foward and Reverse) 5μL
    • 10×buffer 10μL
    • dNTPmix 10μL
    • vent 1μL
    • dH2O 68μL


  • design insert
    • six histidine loop peptide ("His-loop")
    • アミノ酸配列-Ser-Ser-His-His-His-His-His-His-Ser-Ser
    • encoded by the oligo 5'-TCT-TCT-CAT-CAT-CAT-CAT-CAT-CAT-TCC-TCC-3'
    • and anti oligo 5'-GGA-GGA-ATG-ATG-ATG-ATG-ATG-ATG-AGA-AGA-3'
    • 制限酵素サイトN末端EcoRⅠ,C末端NcoⅠ


  • Ligation pUC19-FliC vector とinsertオリゴをライゲーション.
      • [Reaction Conditions]
    • insertオリゴ 2μL
    • pUC19-FliC vector 2μL
    • ×5 Ligase Buffer 4μL
    • Ligase 1μL
    • dH2O 11μL


  • GelCheck(3973bp)

Gel check.JPG