Tokyo Tech
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[[Tokyo/Hybrid promoter |New part development:Hybrid promoter]] | [[Tokyo/Hybrid promoter |New part development:Hybrid promoter]] | ||
| + | PBとして、2つの入力を受けるプロモータを開発する必要があった | ||
| + | <br>図 概念図、配列とグラフ図 | ||
====1.Dry==== | ====1.Dry==== | ||
[[Tokyo/Formulation |Formulation]] | [[Tokyo/Formulation |Formulation]] | ||
| + | リプレッサーＡ，Ｂ，シグナル分子Ｓの時間変化を式として表し、安定性解析を行った結果、Hill係数が大切であることがわかった | ||
| + | <br>図 3つの式 | ||
====2.Wet==== | ====2.Wet==== | ||
[[Tokyo/Assay |Assay]] | [[Tokyo/Assay |Assay]] | ||
| + | 新しいパーツであるハイブリッドプロモータに関して、大腸菌を用いた実験から、2つの入力それぞれに対するHill係数を求めた。 | ||
| + | <br>図大腸菌の絵、FLAの絵、フィッティングのグラフ | ||
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[[Tokyo/Simulation |Simulation]] | [[Tokyo/Simulation |Simulation]] | ||
| + | wet実験で求められたパラメータを用いて、集団が怠け者の細胞のみとなった場合に、一度不安定化して、続いて働き者と怠け者になれることをStocastic Simulationで確認した。このシステムの挙動に必要な他のパラメータ範囲が判明した。 | ||
| + | <br> | ||
====4.Wet==== | ====4.Wet==== | ||
[[Tokyo/Assay |Assay]] | [[Tokyo/Assay |Assay]] | ||
| + | Simulationを満たすための他のパラメータが現在のプラスミドで可能であるかを、大腸菌を用いた実験で確認した。 | ||
| + | <br> | ||
====5.Future works==== | ====5.Future works==== | ||
Revision as of 18:06, 20 October 2007
1,ProjectConcept: Ant society and Pareto's principle
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2,WorksApproach0.Wet New part development:Hybrid promoter
PBとして、2つの入力を受けるプロモータを開発する必要があった
1.Dry Formulation
リプレッサーＡ，Ｂ，シグナル分子Ｓの時間変化を式として表し、安定性解析を行った結果、Hill係数が大切であることがわかった
2.Wet Assay
新しいパーツであるハイブリッドプロモータに関して、大腸菌を用いた実験から、2つの入力それぞれに対するHill係数を求めた。
3.Dry Simulation
wet実験で求められたパラメータを用いて、集団が怠け者の細胞のみとなった場合に、一度不安定化して、続いて働き者と怠け者になれることをStocastic Simulationで確認した。このシステムの挙動に必要な他のパラメータ範囲が判明した。
4.Wet Assay
Simulationを満たすための他のパラメータが現在のプラスミドで可能であるかを、大腸菌を用いた実験で確認した。
5.Future works3,Achievements
4,About our team
Advisors: Last year's member
Instructors
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