Vector choice

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Our finally vector will be YCplac22.This is a centromeric plasmid,with trip resistence,it's long 4854pb.
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Our final vector will be YCplac22,an YC-type (centromeric) shuttle vector.
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                    [[Image:YCplac22_map.jpg]]
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Selected features                                                               
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'''Vector Information''':
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lac_promoter        142 - 171
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M13_pUC_rev_primer  185 - 207
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'''Vector type''': plasmid
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M13_reverse_primer  206 - 224
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M13_forward20_primer 306 - 290
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'''Size (kb): ''' 4.854
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M13_pUC_fwd_primer  321 - 299
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'''Construct size (kb): ''' 4.854
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CEN4                504 - 1356
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Orf frame 2          2740 - 2066
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TRP1                2740 - 2066
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'''Construction:''' pUC19
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AmpR_promoter        2983 - 3011
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'''Markers:''' TRP1,  ampR
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Orf frame 2          3053 - 3913
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'''Features:''' insert detection: lacZ'
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Ampicillin          3053 - 3913
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'''marker(s):''' TRP1, ampR
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pBR322_origin        4068 - 4687 
+
 +
'''promoter:''' lac
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Unique restriction sites
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'''replicon:''' ARS1, pMB1
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HindIII   233
+
'''MCS:''' HindIII...EcoRI
 +
 
 +
'''centromere:''' CEN4
   
   
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PstI   249
+
                    [[Image:YCplac22_map.jpg]]
 +
 
 +
'''Selected features'''                                                               
 +
    
 +
lac_promoter                      142 - 171
 +
 
 +
M13_pUC_rev_primer                185 - 207
   
   
-
SalI  251
+
M13_reverse_primer                206 - 224
 +
 
 +
M13_forward20_primer              306 - 290
 +
 
 +
M13_pUC_fwd_primer                321 - 299
   
   
-
XbaI  257
+
CEN4                              504 - 1356
   
   
-
BamHI  263
+
Orf frame 2                      2740 - 2066
-
+
 
-
SmaI  270
+
TRP1                              2740 - 2066
-
+
 
-
KpnI  276
+
AmpR_promoter                    2983 - 3011
-
+
 
-
SacI  282
+
Orf frame 2                      3053 - 3913
-
+
 
-
EcoRI  284
+
Ampicillin                        3053 - 3913
-
+
-
NarI  446
+
-
+
-
SpeI  550
+
-
+
-
NheI  1801
+
-
+
-
BglII  1986
+
-
+
-
EcoRV  2455
+
-
+
-
PmlI  2780
+
   
   
-
AatII  2921
+
pBR322_origin                    4068 - 4687

Latest revision as of 11:36, 23 October 2007

Our final vector will be YCplac22,an YC-type (centromeric) shuttle vector.

Vector Information:

Vector type: plasmid

Size (kb): 4.854

Construct size (kb): 4.854

Construction: pUC19

Markers: TRP1, ampR

Features: insert detection: lacZ'

marker(s): TRP1, ampR

promoter: lac

replicon: ARS1, pMB1

MCS: HindIII...EcoRI

centromere: CEN4

                   YCplac22 map.jpg

Selected features

lac_promoter 142 - 171

M13_pUC_rev_primer 185 - 207

M13_reverse_primer 206 - 224

M13_forward20_primer 306 - 290

M13_pUC_fwd_primer 321 - 299

CEN4 504 - 1356

Orf frame 2 2740 - 2066

TRP1 2740 - 2066

AmpR_promoter 2983 - 3011

Orf frame 2 3053 - 3913

Ampicillin 3053 - 3913

pBR322_origin 4068 - 4687