Chiba/Quorum Sensing

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===Improving Sender & Receiver===
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====Super Sender====
*SenderがもっとAHLを合成するようにする。
*SenderがもっとAHLを合成するようにする。
**AHL合成経路でS-adenosyl Methionineのをさらに合成させることでAHLの量を増やす。
**AHL合成経路でS-adenosyl Methionineのをさらに合成させることでAHLの量を増やす。
  metKを発現するSenderの回路を作る。
  metKを発現するSenderの回路を作る。
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====Super Receiver====
*Receiverをもっと高感度にする。
*Receiverをもっと高感度にする。
**論文で読んだmutant LuxRを作成し、AHLの濃度が低くてもpLuxを活性化する。
**論文で読んだmutant LuxRを作成し、AHLの濃度が低くてもpLuxを活性化する。
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(2005).)
(2005).)
  LuxRのアミノ酸 Ile45->Phe, Ser116->Ala この変異を入れ、Sensitiveなレシーバーを作る
  LuxRのアミノ酸 Ile45->Phe, Ser116->Ala この変異を入れ、Sensitiveなレシーバーを作る
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Revision as of 14:44, 23 October 2007

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About Quorum Sensing

クオラムセシングの説明


Experiments

AHL生産能力 Assay

Quorum Sensingをスイッチとして利用するために以下の実験をした。

  • pLuxをアクティブにするためにはどのくらいのSenderが必要なのだろうか
  • SenderとしてAHLを生産する能力の高い株は?(SenderとしてLuxIを発現する株はどのようなものがいいのか)
  • AHLのprecursurであるMethionineを培地に加えることで,Senderはより多くのAHLを合成するのだろうか?
    • AHL合成経路

AHL syn picture.jpg

Result

To Make an AHL Concentration Gradient

  • aiiA (autoinducer inactivation enzyme A): degradate AHLs.
  • aiiAを発現させ、AHLが広がりすぎないようにする
  • aiiAをpluxとinverterの下に置き、AHLが低い濃度ではaiiAを発現させAHLを分解させ、高い濃度ではaiiAが発現しないような回路を作る。
    • thresholdの境がもっとはっきりするようになるだろう。

Rec inv aiia.jpg


Improving Sender & Receiver

Super Sender

  • SenderがもっとAHLを合成するようにする。
    • AHL合成経路でS-adenosyl Methionineのをさらに合成させることでAHLの量を増やす。
metKを発現するSenderの回路を作る。

Super Receiver

  • Receiverをもっと高感度にする。
    • 論文で読んだmutant LuxRを作成し、AHLの濃度が低くてもpLuxを活性化する。

(Collins, C. H., Arnold, F. H. & Leadbetter, J. R. Directed evolution of Vibrio fischeri LuxR for increased sensitivity to a broad spectrum of acyl-homoserine lactones. Mol. Microbiol. 55, 712–723 (2005).)

LuxRのアミノ酸 Ile45->Phe, Ser116->Ala この変異を入れ、Sensitiveなレシーバーを作る