Chiba/Goal
From 2007.igem.org
(→Prediction) |
(→Method) |
||
| Line 71: | Line 71: | ||
#Culture senders and receivers in a test tube and mix Cobalt ion in receiver's tube. | #Culture senders and receivers in a test tube and mix Cobalt ion in receiver's tube. | ||
#Suck senders by capillary and add receivers. | #Suck senders by capillary and add receivers. | ||
| - | #Check | + | #Check marimos. |
=====Prediction===== | =====Prediction===== | ||
If succeeded,AHL from senders spread.<br> | If succeeded,AHL from senders spread.<br> | ||
Revision as of 13:13, 26 October 2007
|
Introduction | Project Design ( 1.Sticky Hands | 2.Communication | 3.Size Control ) | Making Marimos | Our Goal || Team Members | メンバ連絡簿 |
Our Goal
As Final-Construction, we will carry out four experiments.
- A test of adsorption between flagella
- A test to confirm a limit of size
- A test to form Marimo
- A test of size control
A test of adsorption between flagella
Purpose
Confirm adsorption between senders and receivers with His-Tag.
senderとreceiver同士がHis-Tagで吸着しているかを確認するためのテスト
Method
- Culture senders and receivers in a test tube.
- Drop senders into receivers and mix cobalt ion.
- Divide it into two groups. One is added imidazole and the other is non imidazole. Inoculate them on the plates.
- Check the colony.
Prediction
If succeeded, cultures which is added imidazole will form a indipendent colony of senders&receivers. The other (non imidazole) will form colonies of adsorbed senders and receivers.
1.Senderとreceiverをそれぞれ培養し、receiverの培養液の中に、senderを１滴加える。 2.その中に金属イオンを加えると、senderとreceiverが鞭毛同士で吸着し始める。 3.ある程度吸着したら、imidazolを加えたものとそうでないものをプレートにまく。 4.imidazolを加えたものはばらばらのコロニーができ、imidazolなしのものは、senderとreceiverが くっついているので、くっついたコロニーができる。
A test to confirm a limit of size
Purpose
The purpose of this test is to confirm that Marimo has a limit of size.
マリモを作る前の段階として、マリモの成長が有限の大きさで止まるか２次元で確認するためのテストである。
Method
- Culture senders and receivers in a test tube.
- Inoculate receivers equally on the plate, and drop senders at the center of it.
- After over night,pick colonies which are near the senders (colonies express GFP), the end of the circle expressed GFP, and out of the green circle.
- Dilute them.
- Mix cobalt ion into dilutions and inoculate on the plates.
- Check the colony.
Prediction
If succeeded,receivers which don’t express FliC (they didn’t sense AHL and express GFP) form colonies one by one.
And receivers expressed FliC (they sensed AHL and expressed GFP) form aggregated colonies.)
1.senderとreceiverを試験管でそれぞれ培養する。 2.receiverをプレートに均一にまき、senderを真ん中に少量スポットし一晩培養する。 3.senderの近く（GFPを発現している)、中間、遠く（GFPを発現していない）から数箇所ずつ菌をとってそれぞれ希釈液を作る。 4.希釈した菌にCo2+を加えてプレートにまく。 5.FliCを発現していなかったreceiverは、ばらばらのコロニーを作り、FliCを発現していたreceiverは塊になったコロニーを作る。
A test to form Marimo
Purpose
Actually we make Marimos.
- AHLはとても小さな分子で、自由度が高いので、拡散するのが早い。
- キャピラリーを利用することによって、senderが生産するAHLの拡散を遅くし、AHLの濃度勾配を作ることができる。濃度勾配によってより球体に近いマリモができる。
Method
- Culture senders and receivers in a test tube and mix Cobalt ion in receiver's tube.
- Suck senders by capillary and add receivers.
- Check marimos.
Prediction
If succeeded,AHL from senders spread.
Receivers express GFP and FliC-His,and besides,bond with cobalt ions.
Finnally,form marimos.
1.receiverとsenderを一晩培養する。Receiverの培養液の中にはコバルトイオンをまぜておく。 2.キャピラリーでsenderを吸い取り、receiverの培養液の中に加える。 3.Senderの出したAHLが拡散し始める。 4.ReceiverはAHLを感じてGFPを発現する。また鞭毛を生やし、Ni２＋を介してHisタグ同士で吸着し始める。 5.集合が成長してマリモになる。
A test of size control
Purpose
senderとreceiverの量を変化させることによって、まりものサイズを制御するためのテスト。
Method
- senderとreceiverを培養する。
- senderの量を一定にして、receiverの種類・量を変化させ、まりもの大きさの変化をみる。
- receiverの量を一定にして、senderの量を変化させ、マリモの大きさの変化をみる。
Prediction
If succeeded,
Future
- サイズをもっと大きくしてマリモでキャッチボールがしたい
- リポソームの中でマリモを作る
