Chiba/Engeneering Flagella

From 2007.igem.org

(Difference between revisions)

Revision as of 16:38, 26 October 2007

Introduction | Project Design ( 1.Sticky Hands | 2.Communication | 3.Size Control ) | Making Marimos | Our Goal || Team Members | メンバ連絡簿

Our Aim

Fig1.Bacteria Linker

To make a stickey hands on E.coli, we focused on their flagella that are located outside of cells. We used 2 following mechanisms:

Display peptides in flagellar fillament.
The imidasol group in histidines make a complex bond with metal ions.

We combined these two and made a His-tagged flagella (hoping for ? in the hope to ?) stick together via metal ions.

大腸菌同士を吸着させるため，我々は（細胞の外側に突出しているもののうち）鞭毛に着目した．

About flagella

E.Coli have 5-10 flagella randomly distributed around the cell. The flagella is used for swimming and for chemotaxis; runs when they found attractant, tumbles when there is a repellent.

E.coli flagella consist of three parts: a basal body, a hook, and a filament. The filament of E.Coli is a highly rigid, helical, and cylindrical structure which is 10-15μm long and 23nm thick in diameter. It is built from ~20000 subunits of a ~55kDa single protein, FliC. FliC has three domains, D1,D2,D3. Although D1 and D2 are needed for the formation of the functional flagellar filament, D3 does not take part in the formation of flagella. (Ref)

大腸菌は5~10本/細胞の鞭毛を持つ．鞭毛を回転/逆回転させることにより環境の良い場所へとtaxisする．
鞭毛は長さ約10~15μm，半径約23nmの空孔のチューブ状である．（図：菌全体）
鞭毛のフィラメント部はFliCという蛋白質が規則正しく配列した多量体である．（図：鞭毛アップ）
FliCはD0,D1,D2,D3ドメインを持つ．(種類によってはD1,D2,D3の３つのドメインを持つ)
D1とD2はformation of the functional flagellar formation(ffff)の為に必要であるが，D3ドメインは必要でなく可変である（図：蛋白質構造＆鞭毛断面図）

"Variable" FliC D3 domain

It is possible to display proteins(up to 49.4kDa)on the cell surface of E.Coli using flagellin fusion protein.英語変．

可変なD3ドメインに他の＜__aaまでの＞アミノ酸を挿入しても鞭毛が合成される[2].詳細も書く．

References

Kuwajima, G. et al.: Nature Biotechnology, 6, 1080-1083 (1988).
Tanskanen, J. et. al.: Appl. and Env. Microbiol., 4152-4156 (2000)

About Histidine Tag

See [http://en.wikipedia.org/wiki/His-tag wikipedia article].

Experiments

Making FliC-his gene

FliC遺伝子のD3領域に、Histidineループをコードする遺伝子を挿入し、ヒスチジンタグとして発現させる。

We inserted the gene of six histidine loop peptide (“His-Tag”).

Display Check: Beads Adsorption

Purpose

Confirm that the his-tag is displaied on the flagella surface of E.Coli.

Samples

JW1908(⊿fliC株)
- pUC19-fliC-his
- plasmidなし
GI826(⊿fliC⊿motB株)
- pUC19-fliC-his
- plasmidなし

Procedure

pUC19-FliC-His,をJW1908(Keio⊿FliC株)にトランスフォーメーション。培養液をビーズと懸濁させ、大腸菌をBeadsに吸着する。

吸着した大腸菌をbufferで溶出し、inculateする。(Negative Control 1:Noplasmid,Negative Control 2:Co2+あるいはNi2+の有り・無し) →吸着していなかった

pUC19-FliC-His,をGI826(⊿FliC⊿MotB株)にトランスフォーメーション。培養液をビーズと懸濁させ、大腸菌をBeadsに吸着する。

吸着した大腸菌をbufferで溶出し、inculateする。(Negative Control 1:Noplasmid,Negative Control 2:Co2+あるいはNi2+の有り・無し) →吸着していた。

Results

fig2

Plasmidあり、かつCo2+つきビーズ、のコロニー数は、その他のものよりはるかに多い。30倍以上。 Histidine Tagの存在によって大腸菌がビーズに吸着吸着していることがわかる。 The number of colony dramatically decreased with out Co2+ or FliC-His plasmid.

考察も書いたら？　なぜコバルトがニッケルより良いのか？→一般的にニッケルよりコバルトの方が結合力が強いことが知られてて，FilChisに関してもそれは変わらないみたいな・・・

Views

Personal tools