Chiba/Quorum Sensing
From 2007.igem.org
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（なんかいいタイトルないかな）<br> | （なんかいいタイトルないかな）<br> | ||
'''Controlling outlineとか･･･ダサい？by tashiro''' | '''Controlling outlineとか･･･ダサい？by tashiro''' | ||
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===Design1=== | ===Design1=== | ||
Revision as of 17:10, 26 October 2007
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Introduction | Project Design ( 1.Sticky Hands | 2.Communication | 3.Size Control ) | Making Marimos | Our Goal || Team Members | メンバ連絡簿 |
Size Control: Our Aim
（マリモのサイズをコントロールしたい/しなくてはならない：どっち？）マリモのサイズをコントロールする為にはAHLの届く範囲をコントロールできればよい．
- AHLの届く範囲をコントロールするために以下の３つの方法を考えた：
- SenderのAHL生産能力をあげる
- ReceiverのAHL感受性をあげる
- AHL分解酵素aiiAを使う
1.Improving Sender
Design
AHL is synthesized from methionine via metK and luxI.
We thought combined overexpression of these 2 genes enhances the sender capacity.
AHLはFig.2のpathwayで合成されている．AHLを増加させるためにMetKを過剰発現させ，methionineを加えてみる。
Experiment
Result
No difference seen.
Discussion
- 合成されたS-adenosyl Methionineがほかの代謝経路に使われて、AHL合成に使われなかったのだろうか．
2.Improving Receiver
Design
File:Mut LuxRの感度アップグラフ
Collins et al described the hyper-sensitive variants of luxR to AHL :(ref).
We created two types of sensitive luxR mutants.
Experiment
File:作ったmut luxr
sensitive luxR mutants の性能を以下の２つの方法で評価した。
Result
- mutant(I45F,S116A)はAHLを添加しなくてもGFPを発現した。
- mutant(I45F)はwild typeよりもGFPの発現が多くなった。(AHL 10nM)
mLuxRの論文引用したら？ by tashiro
3.Aiia
（なんかいいタイトルないかな）
Controlling outlineとか･･･ダサい？by tashiro
最後に梅野さん達がつくったpptがあったように、Localizing AHL とかでは？by toyotaro
Design1
図のように，AHLのシグナルが入るとaiiaを合成するような回路を考えた．Marimo全体がAHL quencherとして働く．Marimoの内側でAHLを分解し、Marimoの外側のAHL濃度を抑える．
Experiment
Result
- BBa_T9002との比較ではGFPははじめ発現しないが、しばらくするとGFPが発現するようになる。
Discussion
- 発現し始めた時が、AHLの濃度がaiiAの分解る能力を超えた時だと考えられる。
Design2
図のようにインバーターをかませた．高い濃度ではaiiAが発現しないためAHLは分解されない．AHLが低い濃度ではaiiAが発現しAHLを分解する．よってマリモの中心付近ではAHLを分解せず，外側へ行くと分解される．
Experiment
このパーツを作ろうとしたが、inverterを組み合わせた時点で終わってしまった。
Subpart:BBa_S03840
