Chiba/Goal
From 2007.igem.org
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Our Goal:Making Marimo
As Final-Construction, we carry out four experiments.
- A test of adsorption between flagella
- A test to confirm a limit of size
- A test to form Marimo
- A test of size control
A test of adsorption between flagella
Purpose
Confirm adsorption between senders and receivers with His-Tag.
senderとreceiver同士がHis-Tagで吸着しているかを確認するためのテスト
Method
- Culture senders and receivers in a test tube.
- Drop senders into receivers and mix cobalt ion.
- Divide it into two groups. One is added imidazole and the other is non imidazole. Inoculate them on the plates.
- Check the colony. If succeeded, cultures which is added imidazole will form a indipendent colony of senders&receivers. The other (non imidazole) will form colonies of adsorbed senders and receivers.
1.Senderとreceiverをそれぞれ培養し、receiverの培養液の中に、senderを1滴加える。 2.その中に金属イオンを加えると、senderとreceiverが鞭毛同士で吸着し始める。 3.ある程度吸着したら、imidazolを加えたものとそうでないものをプレートにまく。 4.imidazolを加えたものはばらばらのコロニーができ、imidazolなしのものは、senderとreceiverが くっついているので、くっついたコロニーができる。
A test to confirm a limit of size
Purpose
マリモを作る前の段階として、マリモの成長が有限の大きさで止まるか2次元で確認するためのテストである。(The purpose of this test is to confirm that Marimo has a limit of size. )
Method
- We culture senders and receivers in a test tube.
- we inoculate receivers equally on the plate, and drop senders at the center of it.
- After over night, we pick colonies which are near the senders (colonies express GFP), the end of the circle expressed GFP, and out of the green circle.
- we dilute them .
- we mix cobalt ion into dilutions and inoculate on the plates.
- Receivers which don’t express FliC (they didn’t sense AHL and express GFP) form colonies one by one.
- Receivers expressed FliC (they sensed AHL and expressed GFP) form aggregated colonies.)
1.senderとreceiverを試験管でそれぞれ培養する。 2.receiverをプレートに均一にまき、senderを真ん中に少量スポットし一晩培養する。 3.senderの近く(GFPを発現している)、中間、遠く(GFPを発現していない)から数箇所ずつ菌をとってそれぞれ希釈液を作る。 4.希釈した菌にCo2+を加えてプレートにまく。 5.FliCを発現していなかったreceiverは、ばらばらのコロニーを作り、FliCを発現していたreceiverは塊になったコロニーを作る。
A test to form Marimo
Purpose
ついに毬藻を作る!!! (We finally make Marimo!!)
- AHLはとても小さな分子で、自由度が高いので、拡散するのが早い。
- キャピラリーを利用することによって、senderが生産するAHLの拡散を遅くし、AHLの濃度勾配を作ることができる。濃度勾配によってより球体に近いマリモができる。
Method
1.receiverとsenderを一晩培養する。Receiverの培養液の中にはコバルトイオンをまぜておく。 2.キャピラリーでsenderを吸い取り、receiverの培養液の中に加える。 3.Senderの出したAHLが拡散し始める。 4.ReceiverはAHLを感じてGFPを発現する。また鞭毛を生やし、Ni2+を介してHisタグ同士で吸着し始める。 5.集合が成長してマリモになる。
A test of size control
Purpose
senderとreceiverの量を変化させることによって、まりものサイズを制御するためのテスト。
Method
- senderとreceiverを培養する。
- senderの量を一定にして、receiverの種類・量を変化させ、まりもの大きさの変化をみる。
- receiverの量を一定にして、senderの量を変化させ、マリモの大きさの変化をみる。
Future
- サイズをもっと大きくしてマリモでキャッチボールがしたい
- リポソームの中でマリモを作る