From 2007.igem.org

Introduction | Project Design ( 1.Sticky Hands | 2.Communication | 3.Size Control ) | Making Marimos | Our Goal || Team Members | メンバ連絡簿

Size Control: Our Aim

（マリモのサイズをコントロールしたい/しなくてはならない：どっち？）マリモのサイズをコントロールする為にはAHLの届く範囲をコントロールできればよい．

• AHLの届く範囲をコントロールするために以下の３つの方法を考えた：
  1. SenderのAHL生産能力をあげる
  2. ReceiverのAHL感受性をあげる
  3. AHL分解酵素aiiAを使う

1.Improving Sender

Design

AHL is synthesized from methionine via metK and luxI.
We thought combined overexpression of these 2 genes enhances the sender capacity.

AHLはFig.2のpathwayで合成されている．AHLを増加させるためにMetKを過剰発現させ，methionineを加えてみる。

Experiment

Result

No difference seen.

Discussion

• 合成されたS-adenosyl Methionineがほかの代謝経路に使われて、AHL合成に使われなかったのだろうか．

2.Improving Receiver

Design

File:Mut LuxRの感度アップグラフ
Collins et al described the hyper-sensitive variants of luxR to AHL :(ref).
We created two types of sensitive luxR mutants.

Experiment

File:作ったmut luxr
sensitive luxR mutants の性能を以下の２つの方法で評価した。

Result

• mutant(I45F,S116A)はAHLを添加しなくてもGFPを発現した。

• mutant(I45F)はwild typeよりもGFPの発現が多くなった。(AHL 10nM)

mLuxRの論文引用したら？　by tashiro

3.Aiia

（なんかいいタイトルないかな）
Controlling outlineとか･･･ダサい？by tashiro

Design1

図のように，AHLのシグナルが入るとaiiaを合成するような回路を考えた．Marimo全体がAHL quencherとして働く．Marimoの内側でAHLを分解し、Marimoの外側のAHL濃度を抑える．

Experiment

Result

• BBa_T9002との比較ではGFPははじめ発現しないが、しばらくするとGFPが発現するようになる。

Discussion

• 発現し始めた時が、AHLの濃度がaiiAの分解る能力を超えた時だと考えられる。

Design2

図のようにインバーターをかませた．高い濃度ではaiiAが発現しないためAHLは分解されない．AHLが低い濃度ではaiiAが発現しAHLを分解する．よってマリモの中心付近ではAHLを分解せず，外側へ行くと分解される．

Experiment

このパーツを作ろうとしたが、inverterを組み合わせた時点で終わってしまった。

Subpart:BBa_S03840