Tokyo Tech
From 2007.igem.org
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PBとして、2つの入力を受けるプロモータを開発する必要があった | PBとして、2つの入力を受けるプロモータを開発する必要があった | ||
<br>図 概念図、配列とグラフ図 | <br>図 概念図、配列とグラフ図 | ||
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リプレッサーA,B,シグナル分子Sの時間変化を式として表し、安定性解析を行った結果、Hill係数が大切であることがわかった | リプレッサーA,B,シグナル分子Sの時間変化を式として表し、安定性解析を行った結果、Hill係数が大切であることがわかった | ||
<br>図 3つの式 | <br>図 3つの式 | ||
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新しいパーツであるハイブリッドプロモータに関して、大腸菌を用いた実験から、2つの入力それぞれに対するHill係数を求めた。 | 新しいパーツであるハイブリッドプロモータに関して、大腸菌を用いた実験から、2つの入力それぞれに対するHill係数を求めた。 | ||
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wet実験で求められたパラメータを用いて、集団が怠け者の細胞のみとなった場合に、一度不安定化して、続いて働き者と怠け者になれることをStocastic Simulationで確認した。このシステムの挙動に必要な他のパラメータ範囲が判明した。 | wet実験で求められたパラメータを用いて、集団が怠け者の細胞のみとなった場合に、一度不安定化して、続いて働き者と怠け者になれることをStocastic Simulationで確認した。このシステムの挙動に必要な他のパラメータ範囲が判明した。 | ||
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Simulationを満たすための他のパラメータが現在のプラスミドで可能であるかを、大腸菌を用いた実験で確認した。 | Simulationを満たすための他のパラメータが現在のプラスミドで可能であるかを、大腸菌を用いた実験で確認した。 | ||
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Revision as of 20:04, 20 October 2007
1,ProjectConcept: Ant society and Pareto's principleModel : Bacterial society that follows Pareto's principleRequirements: bistability and cell-cell communicationGenetic circuit:Quorum SensingSimulation:using parameters from our wet experiments |
2,WorksApproach:WetとDryを交互に行った。2-0.Wet New part development:Hybrid promoter
PBとして、2つの入力を受けるプロモータを開発する必要があった
2-1.Dry Formulation
リプレッサーA,B,シグナル分子Sの時間変化を式として表し、安定性解析を行った結果、Hill係数が大切であることがわかった
2-2.Wet Assay
新しいパーツであるハイブリッドプロモータに関して、大腸菌を用いた実験から、2つの入力それぞれに対するHill係数を求めた。
2-3.Dry Simulation
wet実験で求められたパラメータを用いて、集団が怠け者の細胞のみとなった場合に、一度不安定化して、続いて働き者と怠け者になれることをStocastic Simulationで確認した。このシステムの挙動に必要な他のパラメータ範囲が判明した。
2-4.Wet Assay
Simulationを満たすための他のパラメータが現在のプラスミドで可能であるかを、大腸菌を用いた実験で確認した。
2-5.Future works3,Achievements
4,About our team
Advisors: Last year's member
Instructors
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