1,Project

Concept: Ant society and Pareto's principle

Model : Bacterial society that follows Pareto's principle

Requirements: bistability and cell-cell communication

Genetic circuit:Quorum Sensing

Simulation:using parameters from our wet experiments

2,Works

Approach:WetとDryを交互に行った。

2-0.Wet

Hybrid promoter: New part development:Hybrid promoterPBとして、2つの入力を受けるプロモータを開発する必要があった
図　概念図、配列とグラフ図

2-1.Dry

Formulation: リプレッサーＡ，Ｂ，シグナル分子Ｓの時間変化を式として表し、安定性解析を行った結果、Hill係数が大切であることがわかった
図　3つの式

2-2.Wet

Assay: 新しいパーツであるハイブリッドプロモータに関して、大腸菌を用いた実験から、2つの入力それぞれに対するHill係数を求めた。
図大腸菌の絵、FLAの絵、フィッティングのグラフ

2-3.Dry

Simulation: wet実験で求められたパラメータを用いて、集団が怠け者の細胞のみとなった場合に、一度不安定化して、続いて働き者と怠け者になれることをStocastic Simulationで確認した。このシステムの挙動に必要な他のパラメータ範囲が判明した。

2-4.Wet

Assay: Simulationを満たすための他のパラメータが現在のプラスミドで可能であるかを、大腸菌を用いた実験で確認した。

2-5.Future works

4,About our team

Students
Satoru Akama | Kenichiro Iwasaki | Hiroki Kawahara | Hajime Nakatani

Advisors: Last year's member
Syotarou Ayukawa | Akio Kobayashi

Instructors
Daisuke Kiga | Masayuki Yamamura | Masami Hagiya | Masahiko Uchiyama

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