Tokyo Tech
From 2007.igem.org
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- | ===2-1.Dry :[[Tokyo/Formulation |Formulation]]=== | + | ===2-1.Dry : [[Tokyo/Formulation |Formulation]]=== |
<!--リプレッサーA,B,シグナル分子Sの時間変化を式として表し、安定性解析を行った結果、Hill係数が大切であることがわかった | <!--リプレッサーA,B,シグナル分子Sの時間変化を式として表し、安定性解析を行った結果、Hill係数が大切であることがわかった | ||
<br>図 3つの式 | <br>図 3つの式 | ||
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- | ===2-2.Wet | + | ===2-2.Wet : [[Tokyo/Assay |Assay]]=== |
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====We decided the parameter of hill coefficients by the assay of AHL & IPTG==== | ====We decided the parameter of hill coefficients by the assay of AHL & IPTG==== | ||
<!--新しいパーツであるハイブリッドプロモータに関して、大腸菌を用いた実験から、2つの入力それぞれに対するHill係数を求めた。 | <!--新しいパーツであるハイブリッドプロモータに関して、大腸菌を用いた実験から、2つの入力それぞれに対するHill係数を求めた。 | ||
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[[Image:hill AHL.JPG|200px]]|[[Image:hill IPTG.JPG|200px]] | [[Image:hill AHL.JPG|200px]]|[[Image:hill IPTG.JPG|200px]] | ||
- | ===2-3.Dry | + | ===2-3.Dry : [[Tokyo/Simulation |Simulation]]=== |
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wet実験で求められたパラメータを用いて、集団が怠け者の細胞のみとなった場合に、一度不安定化して、続いて働き者と怠け者になれることをStocastic Simulationで確認した。このシステムの挙動に必要な他のパラメータ範囲が判明した。 | wet実験で求められたパラメータを用いて、集団が怠け者の細胞のみとなった場合に、一度不安定化して、続いて働き者と怠け者になれることをStocastic Simulationで確認した。このシステムの挙動に必要な他のパラメータ範囲が判明した。 | ||
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<br>[[Image:Tokyo_simulation_s2.jpg|350px]] | <br>[[Image:Tokyo_simulation_s2.jpg|350px]] | ||
- | ===2-4.Wet | + | ===2-4.Wet : [[Tokyo/Assay |Assay]]=== |
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Simulationを満たすための他のパラメータが現在のプラスミドで可能であるかを、大腸菌を用いた実験で確認した。 | Simulationを満たすための他のパラメータが現在のプラスミドで可能であるかを、大腸菌を用いた実験で確認した。 | ||
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Revision as of 04:58, 21 October 2007
1,ProjectConcept: Ant society and Pareto's principleModel : Bacterial society that follows Pareto's principleRequirements: bistability and cell-cell communicationGenetic circuit:Quorum SensingOur construction parts are Here!!! |
2,WorksApproach:We alternated approach of Wet and Dry.2-0.Wet : Hybrid promoter
2-1.Dry : Formulation2-2.Wet : AssayWe decided the parameter of hill coefficients by the assay of AHL & IPTG2-3.Dry : Simulationwet実験で求められたパラメータを用いて、集団が怠け者の細胞のみとなった場合に、一度不安定化して、続いて働き者と怠け者になれることをStocastic Simulationで確認した。このシステムの挙動に必要な他のパラメータ範囲が判明した。
2-4.Wet : AssaySimulationを満たすための他のパラメータが現在のプラスミドで可能であるかを、大腸菌を用いた実験で確認した。
2-5.Future works3,About our team
Advisors: Last year's member
Instructors
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