Tokyo/Works/Simulation

(Difference between revisions)

Revision as of 21:30, 25 October 2007

Wet experiments have determined Hill coefficients, coefficients of repression and activation of AHL and LacI（n2,n3,k2,k3) as follows.

n2 = 2.08 (-)
K2 = 4.05 (μM)
n3 = 2.47 (-)
K3 = 0.295 (μM)

パラメータλの値によって，AとBが共存して安定する場合と，Aのみ，Bのみになってしまう3つのパターンが生じる．それぞれのパターンについてシミュレーション結果を示すといFig.1-3のようになる．

Fig.1.A 　t=0.0(min)

Fig.1.B 　t=3.0(min)

Fig.1.C 　 t=30(min)　only A

Fig.2.A 　t=0.0(min)

Fig.2.B 　t=3.0(min)

Fig.2.C 　 t=30(min) A and B are coexistence!!

Fig.3.A 　t=0.0(min)

Fig.3.B 　t=3.0(min)

Fig.3.C 　 t=30(min)　only B

３パターンについて，nullclinesの交点が２つになる瞬間の相平面はFig.4.A-Cのようになる．

Fig.4.A

Fig.4.B

Fig.4.C

Fig.4.Aでは，平衡点が二つになった瞬間，cellsは中心付近の不安定平衡点よりA側に存在している．逆に，Fig.4.Cでは，平衡点が二つになった瞬間，cellsは中心付近の不安定平衡点よりもB側に存在している．次に,安定点が

Fig.4

@@ Line 43: / Line 43: @@
 [[Image:2Dpp-ab-tt.JPG|260px|left|thumb|Fig.4.B]]
 [[Image:2Dpp-b-tt.JPG|260px|none|thumb|Fig.4.C]]
-<br>Fig.4.Aでは，中心付近の交点よりB側に
+<br>Fig.4.Aでは，平衡点が二つになった瞬間，cellsは中心付近の不安定平衡点よりA側に存在している．
+逆に，Fig.4.Cでは，平衡点が二つになった瞬間，cellsは中心付近の不安定平衡点よりもB側に存在している．
+次に,安定点が
 ===範囲の提示===