1,Project

Concept: Ant society and Pareto's principle
Model : Bacterial society that follows Pareto's principle

Requirements: bistability and cell-cell communication

Genetic circuit:

Simulation using parameters from our wet experiments:

2,Works

Approach

0.Wet

　New part development:Hybrid promoter PBとして、2つの入力を受けるプロモータを開発する必要があった
図　概念図、配列とグラフ図

1.Dry

　Formulation リプレッサーＡ，Ｂ，シグナル分子Ｓの時間変化を式として表し、安定性解析を行った結果、Hill係数が大切であることがわかった
図　3つの式

2.Wet

　Assay 新しいパーツであるハイブリッドプロモータに関して、大腸菌を用いた実験から、2つの入力それぞれに対するHill係数を求めた。
図大腸菌の絵、FLAの絵、フィッティングのグラフ

3.Dry

　Simulation wet実験で求められたパラメータを用いて、集団が怠け者の細胞のみとなった場合に、一度不安定化して、続いて働き者と怠け者になれることをStocastic Simulationで確認した。このシステムの挙動に必要な他のパラメータ範囲が判明した。

4.Wet

　Assay Simulationを満たすための他のパラメータが現在のプラスミドで可能であるかを、大腸菌を用いた実験で確認した。

5.Future works

3,Achievements

Hybrid promoter
Bistability analysis
Others

4,About our team

Students
Satoru Akama | Kenichiro Iwasaki | Hiroki Kawahara | Hajime Nakatani

Advisors: Last year's member
Syotarou Ayukawa | Akio Kobayashi

Instructors
[http://www.sb.dis.titech.ac.jp/ Daisuke Kiga] | [http://www.es.dis.titech.ac.jp/ Masayuki Yamamura] | [http://nicosia.is.s.u-tokyo.ac.jp/~hagiya/ Masami Hagiya] | [http://www.sb.dis.titech.ac.jp/ Masahiko Uchiyama]

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