Tokyo/Works/Assay2

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<br>Fomulationで建てた式に必要なパラメータをAssay1により実験的に求めた。それを導入した結果を解析したところ、以下の実験の必要性が浮かび上がった。
<br>Fomulationで建てた式に必要なパラメータをAssay1により実験的に求めた。それを導入した結果を解析したところ、以下の実験の必要性が浮かび上がった。
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==Endogenous AHL assay==
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== [[Tokyo/Activation check by cell-produced AHL |Activation check by cell-produced AHL ]] ==
==== Purpose ====  
==== Purpose ====  
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このアッセイは、ハイブリッドプロモーターが活性化するのに必要とするAHLを細胞から産生できるかを確かめるアッセイである。
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AHLを産出するためのORFをPSB1(high copy),pSB4(low copy),PBRの3つのプラスミドで試した。
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To check if worker E. coli (Sender) can produce enough AHL for our model to work by using different copy numbers of plasmids.
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====Result & Conclusion====
====Result & Conclusion====
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[[Image:AHL_assay_endogenous_Results.jpg]]
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<br>Not only high copy number plasmid pSB1, also low copy number plasmid pSB4 and pBR produced enough AHL to activate the LacI hybrid promoter in other cells. Especially, pBR remarkably produced AHL in the present experiment.
==Comparison of promoter activity==
==Comparison of promoter activity==
==== Purpose ====  
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====Result & Conclusion====
====Result & Conclusion====

Revision as of 02:50, 24 October 2007


Works top  0.Hybrid promoter  1.Formulation  2.Assay1  3.Simulation  4.Assay2  5.Future works


Fomulationで建てた式に必要なパラメータをAssay1により実験的に求めた。それを導入した結果を解析したところ、以下の実験の必要性が浮かび上がった。

Activation check by cell-produced AHL

Purpose

To check if worker E. coli (Sender) can produce enough AHL for our model to work by using different copy numbers of plasmids.


Result & Conclusion

AHL assay endogenous Results.jpg



Not only high copy number plasmid pSB1, also low copy number plasmid pSB4 and pBR produced enough AHL to activate the LacI hybrid promoter in other cells. Especially, pBR remarkably produced AHL in the present experiment.

Comparison of promoter activity

Purpose

Result & Conclusion