Tokyo/Works/Future works
From 2007.igem.org
(→RBSをかえることでのパーツの調整) |
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<br>[[Tokyo/Works|Works top]] 0.[[Tokyo/Works/Hybrid promoter|Hybrid promoter]] 1.[[Tokyo/Works/Formulation |Formulation]] 2.[[Tokyo/Works/Assay |Assay1]] 3.[[Tokyo/Works/Simulation |Simulation]] 4.[[Tokyo/Works/Assay2 |Assay2]] 5.[[Tokyo/Works/Future works |Future works]] | <br>[[Tokyo/Works|Works top]] 0.[[Tokyo/Works/Hybrid promoter|Hybrid promoter]] 1.[[Tokyo/Works/Formulation |Formulation]] 2.[[Tokyo/Works/Assay |Assay1]] 3.[[Tokyo/Works/Simulation |Simulation]] 4.[[Tokyo/Works/Assay2 |Assay2]] 5.[[Tokyo/Works/Future works |Future works]] | ||
| - | ==RBSをかえることでのパーツの調整== | + | |
| + | == Balancing gene expression == | ||
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| + | <!--==RBSをかえることでのパーツの調整==--> | ||
<!--シミュレーションの結果をみると、プロモータのバランスは大幅に変更する必要が見込まれることがわかった。 | <!--シミュレーションの結果をみると、プロモータのバランスは大幅に変更する必要が見込まれることがわかった。 | ||
もちろん、実験とシミュレーションの結果は一致するものではないので今のまま設計を進め、実験を進めることに意味はある。 | もちろん、実験とシミュレーションの結果は一致するものではないので今のまま設計を進め、実験を進めることに意味はある。 | ||
Revision as of 06:41, 25 October 2007
Works top 0.Hybrid promoter 1.Formulation 2.Assay1 3.Simulation 4.Assay2 5.Future works
Balancing gene expression
According to the simulation result, we have found that the relative strength of the promoters of both sides, or relative expression levels of the downstream genes should be changed in order to reach our model. It might be possible to get closer to our goal by extremely focusing on such Wet experiments undergoing a number of trial-and-errors. However, now that we have almost obtained the strong methods of Dry approaches that compensate Wet ones, we can employ even more sophisticated methods as we have done in this project. We have estimated based on the simulation what should be done next. One option is to changing the ribosomal binding sites (RBS) to modulate largely expression level of the downstream genes. There are different RBS available as BioBrick parts, we could choose proper strength of RBS. Balancing the expression levels of both sides must be a great leap to our goal.
本ｱｯｾｲへ
今回の系は、全体の挙動が共存安定ある。よって、全コンストラクト
アダプター
遺伝子回路の設計では、今回のように、ある程度コンストラクトを進めたのちにパーツの交換をしたくなるようなことが多々あるであろう。残念ながら、iGEMパーツは前後にパーツを組み合わせていくものになるので、途中のパーツの入れ替えは難しい。 そこで我々は昨年提案したTSDstandard と合わせてアダプターという概念を提唱したい。⇒パーツページへリンク。
