Chiba/Communication
From 2007.igem.org
(→Our Construct) |
(→About Quorum Sensing) |
||
| Line 15: | Line 15: | ||
==About Quorum Sensing== | ==About Quorum Sensing== | ||
[[Image:Chiba_aboutqs.png|frame|'''Fig2.''']] | [[Image:Chiba_aboutqs.png|frame|'''Fig2.''']] | ||
| + | Quorum Sinsing is cell-to-cell signaling action of bacteria. | ||
| + | Detect the cell density of same species and coordinating the behavior of cells within a population. | ||
| + | Species of Gram-Negativfe signaling information transfer molecule (autoinducer) is acyl homoserine lactone (AHL).When AHL concentration exceed threshold thus the cell population over a certain number, AHL regulated promoter is activated transcription. | ||
クオラムセンシングとは，バクテリアが細胞間で行うシグナル伝達のシステムである．自分と同種の菌の生息密度を感知して、それに応じて物質の産生をコントロールする．情報伝達に使用している化合物（オートインデューサー）はグラム陰性菌の場合AHLである．AHLの濃度がある値以上になる，すなわち細胞密度がある値を超えるとAHL依存性プロモータ（LuxP）のスイッチがオンになり，遺伝子が発現される． | クオラムセンシングとは，バクテリアが細胞間で行うシグナル伝達のシステムである．自分と同種の菌の生息密度を感知して、それに応じて物質の産生をコントロールする．情報伝達に使用している化合物（オートインデューサー）はグラム陰性菌の場合AHLである．AHLの濃度がある値以上になる，すなわち細胞密度がある値を超えるとAHL依存性プロモータ（LuxP）のスイッチがオンになり，遺伝子が発現される． | ||
詳しい遺伝子回路は図に示す通り． | 詳しい遺伝子回路は図に示す通り． | ||
<br clear="all"> | <br clear="all"> | ||
| + | *more about quorum sensing | ||
[http://partsregistry.org/Featured_Parts:Cell-Cell-Signaling Cell-Cell-Signaling] | [http://partsregistry.org/Featured_Parts:Cell-Cell-Signaling Cell-Cell-Signaling] | ||
| + | |||
[http://www.che.caltech.edu/groups/fha/quorum.html About Quorum sensing] | [http://www.che.caltech.edu/groups/fha/quorum.html About Quorum sensing] | ||
Revision as of 18:47, 26 October 2007
|
Introduction | Project Design ( 1.Sticky Hands | 2.Communication | 3.Size Control ) | Making Marimos | Our Goal || Team Members | メンバ連絡簿 |
Communication: Our Aim
違う遺伝子回路を持つ２つの細胞（sender&receiver）に分ける．あらかじめお互い結合しているSenderが，周りのreceiverにシグナルを与えてstickey handsを生やす．そして合体．このシグナルにはQuorum sensingを利用する．
About Quorum Sensing
Quorum Sinsing is cell-to-cell signaling action of bacteria.
Detect the cell density of same species and coordinating the behavior of cells within a population.
Species of Gram-Negativfe signaling information transfer molecule (autoinducer) is acyl homoserine lactone (AHL).When AHL concentration exceed threshold thus the cell population over a certain number, AHL regulated promoter is activated transcription.
クオラムセンシングとは，バクテリアが細胞間で行うシグナル伝達のシステムである．自分と同種の菌の生息密度を感知して、それに応じて物質の産生をコントロールする．情報伝達に使用している化合物（オートインデューサー）はグラム陰性菌の場合AHLである．AHLの濃度がある値以上になる，すなわち細胞密度がある値を超えるとAHL依存性プロモータ（LuxP）のスイッチがオンになり，遺伝子が発現される．
詳しい遺伝子回路は図に示す通り．
- more about quorum sensing
[http://partsregistry.org/Featured_Parts:Cell-Cell-Signaling Cell-Cell-Signaling]
[http://www.che.caltech.edu/groups/fha/quorum.html About Quorum sensing]
Our Construct
Recievers
We Made
- ver.1(BBa_T729006)
- ver2.(BBa_I729005)
From Biobrick
- ver.0(BBa_T9002)
Future Work
- ver3
Sender
We Made
- MetK Sender
From Biobrick
- Sender(BBa_S03623)
futureでLuxIもスイッチできた方が魅力的だと思うんだ。∵ReceiverにSenderを混ぜるのではなく，初めからReceiverとSenderを混ぜた状態で凝集させることができる。ex.)Photoswitch etc... by tashiro
Experiments
Sender Assay
Purpose
- 調べるthe absolute number of senders required to activate pLux.
- 調べる the difference in synthesis ability among Strains.
- 調べるwhether does it change or not when the AHL precursur, methionine, is added. Right we show the AHL synthesis pathway.
Procedure and result
c.f.Improving Sender
1.Senderは少なくとも5x10^4は必要である。 2.Senderの株によってLuxIの活性が違う。
