Tokyo/Formulation

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<イントロ>
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1個体から複数個体に拡張.さらに,n個体での相平面解析とシミュレーションを行った.
1個体から複数個体に拡張.さらに,n個体での相平面解析とシミュレーションを行った.
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AHLの式はfreelyと仮定して,大腸菌内と外とを区別していない.この式で十分現象は表せてる.
しかし,これは
しかし,これは

Revision as of 23:10, 20 October 2007

Contents

1.toggle model

<イントロ> まずは,次元をもっていない単純な式で定性的な振る舞いをみてみる. その結果,安定点が1つのときと2つのときがある.我々が求めているモデルはA状態とB状態をとる必要があるので, 安定点が二つのときである.

2.toggle model with hybrid promoter

<イントロ> ハイブリットプロモータを式に入れ込む必要がある. トグルの抑制項に加えてAHLによってactivateされる項が加わる. これにより相平面がAHLに依存する. 結果,AHLがある量以上ないとbistableにならないことが分かる.

3.AHL-experssing model

<イントロ> 今度は,大腸菌の中からAHLを作り出す系に拡張.より本物に近づいてきている. これにより,相平面が新たなパラメータλによって変化するのがわかる. bistableになるにはある値以上のλでなければならない.

4.population model

<イントロ> 1個体から複数個体に拡張.さらに,n個体での相平面解析とシミュレーションを行った.

AHLの式はfreelyと仮定して,大腸菌内と外とを区別していない.この式で十分現象は表せてる.

しかし,これは 次元をもったちゃんとした式.

ただし,deterministicなため全個体同じ動き.我々のモデルはこれではみれない. stochasticなシミュレーションが要求される.

5.poisson stochastic differential equation model