Tokyo/Formulation
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We use the phaseplane analysis to understand the quantitative behavior of the toggle switch. | We use the phaseplane analysis to understand the quantitative behavior of the toggle switch. | ||
As a result,the toggle model has three kinds of phaseplanes,from one to three equilibrium points. when one equilibrium point,only one stable equilibrium point | As a result,the toggle model has three kinds of phaseplanes,from one to three equilibrium points. when one equilibrium point,only one stable equilibrium point |
Revision as of 17:33, 20 October 2007
Contents |
1.toggle model
パラメータによって相平面が変わり,平衡点が1つのときと3つのときがある. 平衡点が3つのときbistableになり,A状態,B状態ができる.
2.toggle model with hybrid promoter
ahlの項が入ることにより,相平面がAHLの量に依存. パラメターの他にAHL量もbistableをとる大切なポイントになる. ある一定量AHLがないとbistableにならない.
3.AHL-experssing model
3本目の微分方程式が入ることにより,新たなパラメターλが出てくる. このλの値によって相平面が変化する. AHLの式はfreelyと仮定して,大腸菌内と外とを区別していない.これで十分.
4.population model
次元をもったちゃんとした式.
1個体から複数個体にする.これにより,個体数Nの影響がでてくる. AHLの量がごっと増える.
ただし,deterministicなため全個体同じ動き.我々のモデルはこれではみれない. stochasticなシミュレーションが要求される.