Tokyo/Formulation
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And, we need three equilibrium points for the toggle to be bistable.--> | And, we need three equilibrium points for the toggle to be bistable.--> | ||
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| + | その結果，安定点が１つのときと２つのときがある．我々が求めているのは安定点が二つのとき． | ||
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パラメータによって相平面が変わり，平衡点が１つのときと３つのときがある． | パラメータによって相平面が変わり，平衡点が１つのときと３つのときがある． | ||
平衡点が３つのときbistableになり，A状態，B状態ができる． | 平衡点が３つのときbistableになり，A状態，B状態ができる． | ||
| + | （シミュレーション） | ||
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== [[Tokyo/Formulation/2.toggle model with hybrid promoter |2.toggle model with hybrid promoter ]] == | == [[Tokyo/Formulation/2.toggle model with hybrid promoter |2.toggle model with hybrid promoter ]] == | ||
Revision as of 17:38, 20 October 2007
Contents |
1.toggle model
＜イントロ＞ まずは，次元をもっていない単純な式で定性的な振る舞いをみてみる． その結果，安定点が１つのときと２つのときがある．我々が求めているのは安定点が二つのとき．
＜中身＞ （相平面解析） パラメータによって相平面が変わり，平衡点が１つのときと３つのときがある． 平衡点が３つのときbistableになり，A状態，B状態ができる． （シミュレーション） 初期値を安定点付近から始めるとちゃんとそのまま安定してるよ
2.toggle model with hybrid promoter
ahlの項が入ることにより，相平面がAHLの量に依存． パラメターの他にAHL量もbistableをとる大切なポイントになる． ある一定量AHLがないとbistableにならない．
3.AHL-experssing model
3本目の微分方程式が入ることにより,新たなパラメターλが出てくる. このλの値によって相平面が変化する． AHLの式はfreelyと仮定して，大腸菌内と外とを区別していない．これで十分．
4.population model
次元をもったちゃんとした式．
１個体から複数個体にする．これにより，個体数Nの影響がでてくる． AHLの量がごっと増える．
ただし，deterministicなため全個体同じ動き．我々のモデルはこれではみれない． stochasticなシミュレーションが要求される．
