Tokyo Tech

From 2007.igem.org

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===[[Tokyo/Approach |Approach]]:We alternated approach of Wet and Dry.===
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===2-0.Wet===
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====We need to develop the promoter that can receive two input,AHL & reperssor.We tryed to create and [[Tokyo/Hybrid promoter|successed]]!! ====
====We need to develop the promoter that can receive two input,AHL & reperssor.We tryed to create and [[Tokyo/Hybrid promoter|successed]]!! ====
<!--New part development:Hybrid promoterPBとして、2つの入力を受けるプロモータを開発する必要があった
<!--New part development:Hybrid promoterPBとして、2つの入力を受けるプロモータを開発する必要があった
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===2-1.Dry===
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<!--リプレッサーA,B,シグナル分子Sの時間変化を式として表し、安定性解析を行った結果、Hill係数が大切であることがわかった
<!--リプレッサーA,B,シグナル分子Sの時間変化を式として表し、安定性解析を行った結果、Hill係数が大切であることがわかった
<br>図 3つの式
<br>図 3つの式

Revision as of 04:56, 21 October 2007

Tokyotech3.JPG

1,Project

Concept: Ant society and Pareto's principle


Ant society.JPG

Model : Bacterial society that follows Pareto's principle


TOP.JPG

Requirements: bistability and cell-cell communication


Bistability.JPG
Coexistence.JPG

Genetic circuit:Quorum Sensing


Tokyo genetic circuit s.jpg

Our construction parts are Here!!!

2,Works

Approach:We alternated approach of Wet and Dry.

2-0.Wet :Hybrid promoter

We need to develop the promoter that can receive two input,AHL & reperssor.We tryed to create and successed!!

Hybrid.JPG

2-1.Dry :Formulation

2-2.Wet

Assay

We decided the parameter of hill coefficients by the assay of AHL & IPTG

Hill AHL.JPG|Hill IPTG.JPG

2-3.Dry

Simulation: wet実験で求められたパラメータを用いて、集団が怠け者の細胞のみとなった場合に、一度不安定化して、続いて働き者と怠け者になれることをStocastic Simulationで確認した。このシステムの挙動に必要な他のパラメータ範囲が判明した。

Tokyo simulation s2.jpg

2-4.Wet

Assay: Simulationを満たすための他のパラメータが現在のプラスミドで可能であるかを、大腸菌を用いた実験で確認した。

2-5.Future works

3,About our team


Students
Satoru Akama | Kenichiro Iwasaki | Hiroki Kawahara | Hajime Nakatani

Advisors: Last year's member
Syotarou Ayukawa | Akio Kobayashi

Instructors
[http://www.sb.dis.titech.ac.jp/ Daisuke Kiga] | [http://www.es.dis.titech.ac.jp/ Masayuki Yamamura] | [http://nicosia.is.s.u-tokyo.ac.jp/~hagiya/ Masami Hagiya] | [http://www.sb.dis.titech.ac.jp/ Masahiko Uchiyama]

Links sunaba