Tokyo Tech
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===[[Tokyo/Approach |Approach]]:We alternated approach of Wet and Dry for our goal.=== | ===[[Tokyo/Approach |Approach]]:We alternated approach of Wet and Dry for our goal.=== | ||
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|width="350px" valign="top" | | |width="350px" valign="top" | | ||
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- | === | + | ===1.Dry : [[Tokyo/Formulation |Formulation]]=== |
We writed the Formulation | We writed the Formulation | ||
<!--リプレッサーA,B,シグナル分子Sの時間変化を式として表し、安定性解析を行った結果、Hill係数が大切であることがわかった | <!--リプレッサーA,B,シグナル分子Sの時間変化を式として表し、安定性解析を行った結果、Hill係数が大切であることがわかった | ||
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--> | --> | ||
- | === | + | ===2.Wet : [[Tokyo/Assay |Assay]]=== |
====We decided the parameter of hill coefficients by the assay of AHL & IPTG==== | ====We decided the parameter of hill coefficients by the assay of AHL & IPTG==== | ||
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[[Image:hill AHL.JPG|190px]]|[[Image:hill IPTG.JPG|190px]] | [[Image:hill AHL.JPG|190px]]|[[Image:hill IPTG.JPG|190px]] | ||
- | === | + | ===3.Dry : [[Tokyo/Simulation |Simulation]]=== |
wet実験で求められたパラメータを用いて、集団が怠け者の細胞のみとなった場合に、一度不安定化して、続いて働き者と怠け者になれることをStocastic Simulationで確認した。このシステムの挙動に必要な他のパラメータ範囲が判明した。 | wet実験で求められたパラメータを用いて、集団が怠け者の細胞のみとなった場合に、一度不安定化して、続いて働き者と怠け者になれることをStocastic Simulationで確認した。このシステムの挙動に必要な他のパラメータ範囲が判明した。 | ||
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<br>[[Image:Tokyo_simulation_s2.jpg|350px]] | <br>[[Image:Tokyo_simulation_s2.jpg|350px]] | ||
- | === | + | ===4.Wet : [[Tokyo/Assay |Assay]]=== |
<!--====We determined the feasibility test of this ====--> | <!--====We determined the feasibility test of this ====--> | ||
Simulationを満たすための他のパラメータが現在のプラスミドで可能であるかを、大腸菌を用いた実験で確認した。 | Simulationを満たすための他のパラメータが現在のプラスミドで可能であるかを、大腸菌を用いた実験で確認した。 | ||
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- | === | + | ===5.Future works=== |
Revision as of 19:58, 21 October 2007
1,ProjectConcept & ModelWe made bacterial society that follows Pareto's principle,for example ,Ant societyRequirementsOur requirements for construction this model are two things,bistability and coexistence by cell-cell communicationGenetic circuitWe constructed the genetic circuit to fill its requirements. Therefore we made new partsOur construction parts are Here!!!Our GOALWe indicated our goal of the project by the simulation!! The simulation proved that our genetic circuit have existence of solution. |
2,WorksApproach:We alternated approach of Wet and Dry for our goal.0.Wet : Hybrid promoter
1.Dry : FormulationWe writed the Formulation 2.Wet : AssayWe decided the parameter of hill coefficients by the assay of AHL & IPTG3.Dry : Simulationwet実験で求められたパラメータを用いて、集団が怠け者の細胞のみとなった場合に、一度不安定化して、続いて働き者と怠け者になれることをStocastic Simulationで確認した。このシステムの挙動に必要な他のパラメータ範囲が判明した。
4.Wet : AssaySimulationを満たすための他のパラメータが現在のプラスミドで可能であるかを、大腸菌を用いた実験で確認した。
5.Future works3,About our team
Advisors: Last year's member
Instructors
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