Tokyo/sunaba
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<!-- ===[[Tokyo/Model |Model ]]: Bacterial society that follows Pareto's principle=== --> | <!-- ===[[Tokyo/Model |Model ]]: Bacterial society that follows Pareto's principle=== --> | ||
<br>[[Image:TOP.JPG|350px]] | <br>[[Image:TOP.JPG|350px]] | ||
+ | <br> (木賀)ここに文字を入れると左カラムが間延びするのでよくない。図に少し説明入れて、文章はクリックしたら出るようにするべきか。それとも2カラム制をあきらめる?In the worker ants, we can find true workers and idlers even though they have the same genome. In the abscence of the ture workers, a part of idlers become the true worker. We tried to construct such society of bacteria. | ||
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+ | ===[[Tokyo/Requirements |Requirements]]:<br> bistability and cell-cell communication=== | ||
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===2-1.Dry : [[Tokyo/Formulation |Formulation]]=== | ===2-1.Dry : [[Tokyo/Formulation |Formulation]]=== | ||
We wrote the Formulation | We wrote the Formulation | ||
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+ | <br>[[Image:expression3-1.jpg|200px|]][[Image:AHLresponse2-2.jpg|200px|]] | ||
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<!--リプレッサーA,B,シグナル分子Sの時間変化を式として表し、安定性解析を行った結果、Hill係数が大切であることがわかった | <!--リプレッサーA,B,シグナル分子Sの時間変化を式として表し、安定性解析を行った結果、Hill係数が大切であることがわかった | ||
<br>図 3つの式 | <br>図 3つの式 | ||
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wet実験で求められたパラメータを用いて、集団が怠け者の細胞のみとなった場合に、一度不安定化して、続いて働き者と怠け者になれることをStocastic Simulationで確認した。このシステムの挙動に必要な他のパラメータ範囲が判明した。 | wet実験で求められたパラメータを用いて、集団が怠け者の細胞のみとなった場合に、一度不安定化して、続いて働き者と怠け者になれることをStocastic Simulationで確認した。このシステムの挙動に必要な他のパラメータ範囲が判明した。 | ||
- | <br> | + | <br>(誰かの提案)最終日に動画と差し替え?? |
<br>(木賀)はい、動画ではなくても、左カラムとは別の図にしましょう。 | <br>(木賀)はい、動画ではなくても、左カラムとは別の図にしましょう。 | ||
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Latest revision as of 19:12, 21 October 2007
砂場。
1,Project summaryConcept& model: Bacterial society that follows Pareto's principle like ant society
Requirements:
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2,WorksApproach:We alternated approach of Wet and Dry.2-0.Wet : Hybrid promoter
2-1.Dry : FormulationWe wrote the Formulation 2-2.Wet : AssayWe decided the parameter of hill coefficients by the assay of AHL & IPTG2-3.Dry : Simulationwet実験で求められたパラメータを用いて、集団が怠け者の細胞のみとなった場合に、一度不安定化して、続いて働き者と怠け者になれることをStocastic Simulationで確認した。このシステムの挙動に必要な他のパラメータ範囲が判明した。
2-4.Wet : AssaySimulationを満たすための他のパラメータが現在のプラスミドで可能であるかを、大腸菌を用いた実験で確認した。
2-5.Future works3,About our team
Advisors: Last year's member
Instructors
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