Chiba/Week1

From 2007.igem.org

(Difference between revisions)
(→8/17(Thu))
(→8/17(Thu))
Line 53: Line 53:
|}
|}
-
 
-
 
-
{| border="1" cellspacing="0" cellpadding="4" align="center"
 
-
|-
 
-
!Recipe(単位：μ)
 
-
!①
 
-
!②
 
-
!③
 
-
!④
 
-
!⑤
 
-
!⑥
 
-
!⑦
 
-
!⑧
 
-
!⑨
 
-
!⑩
 
-
!⑪
 
-
!⑫
 
-
!⑬
 
-
!⑭
 
-
!⑮
 
-
|-
 
-
|pUC19-FliC
 
-
|1
 
-
|1
 
-
|1
 
-
|1
 
-
|1
 
-
|1
 
-
|1
 
-
|1
 
-
|1
 
-
|1
 
-
|1
 
-
|1
 
-
|1
 
-
|1
 
-
|1
 
-
|-
 
-
|FliC-207F
 
-
|5
 
-
|
 
-
|
 
-
|
 
-
|
 
-
|
 
-
|
 
-
|
 
-
|
 
-
|
 
-
|
 
-
|
 
-
|
 
-
|
 
-
|
 
-
|-
 
-
|FliC-207R
 
-
|5
 
-
|5
 
-
|
 
-
|5
 
-
|
 
-
|
 
-
|5
 
-
|
 
-
|
 
-
|
 
-
|5
 
-
|
 
-
|
 
-
|
 
-
|
 
-
|-
 
-
|FliC-228F
 
-
|
 
-
|5
 
-
|5
 
-
|
 
-
|
 
-
|
 
-
|
 
-
|
 
-
|
 
-
|
 
-
|
 
-
|
 
-
|
 
-
|
 
-
|
 
-
|-
 
-
|FliC-228R
 
-
|
 
-
|
 
-
|5
 
-
|
 
-
|5
 
-
|
 
-
|
 
-
|5
 
-
|
 
-
|
 
-
|
 
-
|5
 
-
|
 
-
|
 
-
|
 
-
|-
 
-
|FliC-240F
 
-
|
 
-
|
 
-
|
 
-
|5
 
-
|5
 
-
|5
 
-
|
 
-
|
 
-
|
 
-
|
 
-
|
 
-
|
 
-
|
 
-
|
 
-
|
 
-
|-
 
-
|FliC-240R
 
-
|
 
-
|
 
-
|
 
-
|
 
-
|
 
-
|5
 
-
|
 
-
|
 
-
|
 
-
|5
 
-
|
 
-
|
 
-
|5
 
-
|
 
-
|
 
-
|-
 
-
|FliC-252F
 
-
|
 
-
|
 
-
|
 
-
|
 
-
|
 
-
|
 
-
|5
 
-
|5
 
-
|5
 
-
|5
 
-
|
 
-
|
 
-
|
 
-
|
 
-
|
 
-
|-
 
-
|FliC-252R
 
-
|
 
-
|
 
-
|
 
-
|
 
-
|
 
-
|
 
-
|
 
-
|
 
-
|
 
-
|5
 
-
|
 
-
|
 
-
|
 
-
|5
 
-
|
 
-
|-
 
-
|FliC-267F
 
-
|
 
-
|
 
-
|
 
-
|
 
-
|
 
-
|
 
-
|
 
-
|
 
-
|
 
-
|
 
-
|5
 
-
|5
 
-
|5
 
-
|5
 
-
|5
 
-
|-
 
-
|FliC-267R
 
-
|
 
-
|
 
-
|
 
-
|
 
-
|
 
-
|
 
-
|
 
-
|
 
-
|
 
-
|
 
-
|
 
-
|
 
-
|
 
-
|
 
-
|5
 
-
|-
 
-
|10×Buffer
 
-
|10
 
-
|10
 
-
|10
 
-
|10
 
-
|10
 
-
|10
 
-
|10
 
-
|10
 
-
|10
 
-
|10
 
-
|10
 
-
|10
 
-
|10
 
-
|10
 
-
|10
 
-
|-
 
-
|dNTPmix
 
-
|10
 
-
|10
 
-
|10
 
-
|10
 
-
|10
 
-
|10
 
-
|10
 
-
|10
 
-
|10
 
-
|10
 
-
|10
 
-
|10
 
-
|10
 
-
|10
 
-
|10
 
-
|-
 
-
|Vent
 
-
|1
 
-
|1
 
-
|1
 
-
|1
 
-
|1
 
-
|1
 
-
|1
 
-
|1
 
-
|1
 
-
|1
 
-
|1
 
-
|1
 
-
|1
 
-
|1
 
-
|1
 
-
|-
 
-
|dH2O
 
-
|68
 
-
|68
 
-
|68
 
-
|68
 
-
|68
 
-
|68
 
-
|68
 
-
|68
 
-
|68
 
-
|68
 
-
|68
 
-
|68
 
-
|68
 
-
|68
 
-
|68
 
-
|-
 
-
|Total
 
-
|100
 
-
|100
 
-
|100
 
-
|100
 
-
|100
 
-
|100
 
-
|100
 
-
|100
 
-
|100
 
-
|100
 
-
|100
 
-
|100
 
-
|100
 
-
|100
 
-
|100
 
-
|-
 
-
|}
 
== 8/18(Fri) ==
== 8/18(Fri) ==
== 8/19(Sat) ==
== 8/19(Sat) ==

Revision as of 07:31, 16 September 2007

FliC Group AHL Group

Contents

8/17(Thu)

  • pUC-FliCのPCR
F/R FliC-207 FliC-228 FliC-240 FliC-252 FliC-267
FliC-207 ①
FliC-228 ② ③
FliC-240 ④ ⑤ ⑥
FliC-252 ⑦ ⑧ ⑨ ⑩
FliC-267 ⑪ ⑫ ⑬ ⑭ ⑮

8/18(Fri)

8/19(Sat)

8/20(Sun)

8/16(Wed)

AHL Expression Test

BiobrickのAHLsender&recieverを使ってシグナル伝達してるかテスト．

  • 使用したパーツ
    • Reciever: [http://partsregistry.org/Part:BBa_T9002 BBa_T9002] (TetP-LuxR-T-LuxP-GFP-T)
    • Sender1:[http://partsregistry.org/Part:BBa_S03608 BBa_S03608] (LacP-LuxI)
    • Sender2:[http://partsregistry.org/Part:BBa_S03623 BBa_S03623] (TetP-LuxI)
  • 条件
    • Strain:XL10
    • 液体培地(LB-Amp)
    • 固体培地(LB-Amp/1.5% Agar)
    • SwarmPlate(Triptone-Amp/0.25% Agar)
  • 実験結果
    • （福富くんに聞く)
    • Sender2・[http://partsregistry.org/Part:BBa_S03623 BBa_S03623] (TetP-LuxI) の方がAHL放出量が多い
      • 使ったE.coli（Strain:XL10) 内にLacR有がTetR無い
      • よってLacPはある程度抑制されているがTetPは抑制されていない
  • Notes
    • XL10はAHLをあまりつくらないことを後から知った．田代さん達の実験データよりBW25113とかHB101が良い

8/17(Thu)

AHL Expression Test その２

以下のように条件を変えて8/16と同様にAHL伝達テスト．

  1. プレートを薄くした
  2. Senderを濃くした（遠心）
    • Senderの濃度をあげてもある程度（どれくらい？）でAHLの濃度は収束する
  3. Recieverの濃度ふった
    • Recieverの濃度が高すぎるとAHL生成量（AHL濃度？）が少なくなる
  • 次やること
    • Met(AHLのpre-precursur）加えたプレートでAHL生成量増えるかテスト
    • Agarの濃度ふる
    • Recieverの濃度ふる

8/18(Fri)

8/19(Sat)

8/20(Sun)

Retrieved from "http://2007.igem.org/wiki/index.php/Chiba/Week1"