Tokyo/sunaba
From 2007.igem.org
| Line 7: | Line 7: | ||
{| cellspacing="5" | {| cellspacing="5" | ||
| + | For detailed description of each section, plese click "more infromation" | ||
|width="400px" valign="top" | | |width="400px" valign="top" | | ||
| - | <h1> ''' 1,[[Tokyo/Project |Project]]''' </h1> | + | <h1> ''' 1,[[Tokyo/Project |Project summary]]''' </h1> |
===[[Tokyo/Concept |Concept& model]]: Bacterial society that follows Pareto's principle like ant society=== | ===[[Tokyo/Concept |Concept& model]]: Bacterial society that follows Pareto's principle like ant society=== | ||
<!-- <br>[[Image:Ant society.JPG|350px]]--> | <!-- <br>[[Image:Ant society.JPG|350px]]--> | ||
| Line 21: | Line 22: | ||
<!-- <br>[[Image:Coexistence.JPG|350px]]--> | <!-- <br>[[Image:Coexistence.JPG|350px]]--> | ||
| - | ===[[Tokyo/Genetic circuit|Genetic circuit]]: | + | ===[[Tokyo/Genetic circuit|Genetic circuit with new part]]:=== |
<br>[[Image:Tokyo_genetic circuit_s.jpg|350px]] | <br>[[Image:Tokyo_genetic circuit_s.jpg|350px]] | ||
| - | + | ||
| - | + | ||
===[[Tokyo/simulation|Simulation]]:using parameters from our wet experiments === | ===[[Tokyo/simulation|Simulation]]:using parameters from our wet experiments === | ||
<br>[[Image:Tokyo_simulation_s2.jpg|350px]] | <br>[[Image:Tokyo_simulation_s2.jpg|350px]] | ||
| - | + | ====Our construction parts are [[Tokyo/construction|Here]]!!! ==== | |
| + | |||
|width="500px" valign="top" | | |width="500px" valign="top" | | ||
| Line 41: | Line 42: | ||
|width="350px" valign="top" | | |width="350px" valign="top" | | ||
| - | ==== | + | ====For our circuit, we developped the [[Tokyo/Hybrid promoter|promoter]] that can receive two input,AHL & reperssor.==== |
<!--New part development:Hybrid promoterPBとして、2つの入力を受けるプロモータを開発する必要があった | <!--New part development:Hybrid promoterPBとして、2つの入力を受けるプロモータを開発する必要があった | ||
<br>図 概念図、配列とグラフ図 | <br>図 概念図、配列とグラフ図 | ||
| Line 51: | Line 52: | ||
===2-1.Dry : [[Tokyo/Formulation |Formulation]]=== | ===2-1.Dry : [[Tokyo/Formulation |Formulation]]=== | ||
| - | We | + | We wrote the Formulation |
<!--リプレッサーＡ，Ｂ，シグナル分子Ｓの時間変化を式として表し、安定性解析を行った結果、Hill係数が大切であることがわかった | <!--リプレッサーＡ，Ｂ，シグナル分子Ｓの時間変化を式として表し、安定性解析を行った結果、Hill係数が大切であることがわかった | ||
<br>図 3つの式 | <br>図 3つの式 | ||
Revision as of 09:18, 21 October 2007
砂場。
1,Project summaryConcept& model: Bacterial society that follows Pareto's principle like ant society
Requirements:
Genetic circuit with new part:
Simulation:using parameters from our wet experiments
Our construction parts are Here!!! |
2,WorksApproach:We alternated approach of Wet and Dry.2-0.Wet : Hybrid promoter
2-1.Dry : FormulationWe wrote the Formulation 2-2.Wet : AssayWe decided the parameter of hill coefficients by the assay of AHL & IPTG
2-3.Dry : Simulationwet実験で求められたパラメータを用いて、集団が怠け者の細胞のみとなった場合に、一度不安定化して、続いて働き者と怠け者になれることをStocastic Simulationで確認した。このシステムの挙動に必要な他のパラメータ範囲が判明した。
2-4.Wet : AssaySimulationを満たすための他のパラメータが現在のプラスミドで可能であるかを、大腸菌を用いた実験で確認した。
2-5.Future works3,About our team
Advisors: Last year's member
Instructors
Links sunaba
|
