Chiba/Communication
From 2007.igem.org
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==Our Construct== | ==Our Construct== | ||
===Recievers=== | ===Recievers=== | ||
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*ver.1(BBa_T729006) | *ver.1(BBa_T729006) | ||
**[[Image:BBa I729006 circuit.jpg]] | **[[Image:BBa I729006 circuit.jpg]] | ||
*ver2.(BBa_I729005) | *ver2.(BBa_I729005) | ||
**[[Image:BBa I729005 circuit.jpg]] | **[[Image:BBa I729005 circuit.jpg]] | ||
| - | * | + | ====From Biobrick==== |
| + | *ver.0(BBa_T9002) | ||
| + | **[[Image:T9002 circuit.jpg]] | ||
| + | ====Future Work==== | ||
| + | *ver3 | ||
**[[Image:Rec inv aiia.jpg|357x40px]] | **[[Image:Rec inv aiia.jpg|357x40px]] | ||
===Sender=== | ===Sender=== | ||
| - | + | ====We Made==== | |
| - | + | ||
*MetK Sender | *MetK Sender | ||
[[Image:MetK circuit.jpg]] | [[Image:MetK circuit.jpg]] | ||
| + | ====From Biobrick==== | ||
| + | *Sender(BBa_S03623) | ||
| + | [[Image:BBa s03623.jpg]] | ||
futureでLuxIもスイッチできた方が魅力的だと思うんだ。∵ReceiverにSenderを混ぜるのではなく，初めからReceiverとSenderを混ぜた状態で凝集させることができる。ex.)Photoswitch etc... by tashiro | futureでLuxIもスイッチできた方が魅力的だと思うんだ。∵ReceiverにSenderを混ぜるのではなく，初めからReceiverとSenderを混ぜた状態で凝集させることができる。ex.)Photoswitch etc... by tashiro | ||
Revision as of 17:32, 26 October 2007
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Introduction | Project Design ( 1.Sticky Hands | 2.Communication | 3.Size Control ) | Making Marimos | Our Goal || Team Members | メンバ連絡簿 |
Communication: Our Aim
Fig1. Micro.
違う遺伝子回路を持つ２つの細胞（sender&receiver）に分ける．あらかじめお互い結合しているSenderが，周りのreceiverにシグナルを与えてstickey handsを生やす．そして合体．このシグナルにはQuorum sensingを利用する．
About Quorum Sensing
Fig2.
クオラムセンシングとは，バクテリアが細胞間で行うシグナル伝達のシステムである．自分と同種の菌の生息密度を感知して、それに応じて物質の産生をコントロールする．情報伝達に使用している化合物（オートインデューサー）はグラム陰性菌の場合AHLである．AHLの濃度がある値以上になる，すなわち細胞密度がある値を超えるとAHL依存性プロモータ（LuxP）のスイッチがオンになり，遺伝子が発現される．
詳しい遺伝子回路は図に示す通り．
Cell-Cell-Signaling About Quorum sensing
Our Construct
Recievers
We Made
- ver.1(BBa_T729006)
- ver2.(BBa_I729005)
From Biobrick
- ver.0(BBa_T9002)
Future Work
- ver3
Sender
We Made
- MetK Sender
From Biobrick
- Sender(BBa_S03623)
futureでLuxIもスイッチできた方が魅力的だと思うんだ。∵ReceiverにSenderを混ぜるのではなく，初めからReceiverとSenderを混ぜた状態で凝集させることができる。ex.)Photoswitch etc... by tashiro
Experiments
Sender Assay
Purpose
- 調べるthe absolute number of senders required to activate pLux.
- 調べる the difference in synthesis ability among Strains.
- 調べるwhether does it change or not when the AHL precursur, methionine, is added. Right we show the AHL synthesis pathway.
Procedure and result
c.f.Improving Sender
1.Senderは少なくとも5x10^4は必要である。 2.Senderの株によってLuxIの活性が違う。
