Chiba/Communication

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==About Quorum Sensing==
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Quorum Sinsing is cell-to-cell signaling action of bacteria.
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Detect the cell density of same species and coordinating the behavior of cells within a population.
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Species of Gram-Negativfe signaling information transfer molecule (autoinducer) is acyl homoserine lactone (AHL).When AHL concentration exceed threshold thus the cell population over a certain number, AHL regulated promoter is activated transcription.
クオラムセンシングとは,バクテリアが細胞間で行うシグナル伝達のシステムである.自分と同種の菌の生息密度を感知して、それに応じて物質の産生をコントロールする.情報伝達に使用している化合物(オートインデューサー)はグラム陰性菌の場合AHLである.AHLの濃度がある値以上になる,すなわち細胞密度がある値を超えるとAHL依存性プロモータ(LuxP)のスイッチがオンになり,遺伝子が発現される.
クオラムセンシングとは,バクテリアが細胞間で行うシグナル伝達のシステムである.自分と同種の菌の生息密度を感知して、それに応じて物質の産生をコントロールする.情報伝達に使用している化合物(オートインデューサー)はグラム陰性菌の場合AHLである.AHLの濃度がある値以上になる,すなわち細胞密度がある値を超えるとAHL依存性プロモータ(LuxP)のスイッチがオンになり,遺伝子が発現される.
詳しい遺伝子回路は図に示す通り.
詳しい遺伝子回路は図に示す通り.
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*more about quorum sensing
[http://partsregistry.org/Featured_Parts:Cell-Cell-Signaling Cell-Cell-Signaling]
[http://partsregistry.org/Featured_Parts:Cell-Cell-Signaling Cell-Cell-Signaling]
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[http://www.che.caltech.edu/groups/fha/quorum.html About Quorum sensing]
[http://www.che.caltech.edu/groups/fha/quorum.html About Quorum sensing]

Revision as of 18:47, 26 October 2007

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Introduction | Project Design ( 1.Sticky Hands | 2.Communication | 3.Size Control ) | Making Marimos | Our Goal || Team Members | メンバ連絡簿


Communication: Our Aim

Fig1. Micro.

違う遺伝子回路を持つ2つの細胞(sender&receiver)に分ける.あらかじめお互い結合しているSenderが,周りのreceiverにシグナルを与えてstickey handsを生やす.そして合体.このシグナルにはQuorum sensingを利用する.

About Quorum Sensing

Fig2.

Quorum Sinsing is cell-to-cell signaling action of bacteria. Detect the cell density of same species and coordinating the behavior of cells within a population. Species of Gram-Negativfe signaling information transfer molecule (autoinducer) is acyl homoserine lactone (AHL).When AHL concentration exceed threshold thus the cell population over a certain number, AHL regulated promoter is activated transcription. クオラムセンシングとは,バクテリアが細胞間で行うシグナル伝達のシステムである.自分と同種の菌の生息密度を感知して、それに応じて物質の産生をコントロールする.情報伝達に使用している化合物(オートインデューサー)はグラム陰性菌の場合AHLである.AHLの濃度がある値以上になる,すなわち細胞密度がある値を超えるとAHL依存性プロモータ(LuxP)のスイッチがオンになり,遺伝子が発現される. 詳しい遺伝子回路は図に示す通り.

  • more about quorum sensing

[http://partsregistry.org/Featured_Parts:Cell-Cell-Signaling Cell-Cell-Signaling]

[http://www.che.caltech.edu/groups/fha/quorum.html About Quorum sensing]

Our Construct

Recievers

We Made

  • ver.1(BBa_T729006)
    • BBa I729006 circuit.jpg
  • ver2.(BBa_I729005)
    • BBa I729005 circuit.jpg

From Biobrick

  • ver.0(BBa_T9002)
    • T9002 circuit.jpg

Future Work

  • ver3
    • Rec inv aiia.jpg

Sender

We Made

  • MetK Sender

MetK circuit.jpg

From Biobrick

  • Sender(BBa_S03623)

BBa s03623.jpg

futureでLuxIもスイッチできた方が魅力的だと思うんだ。∵ReceiverにSenderを混ぜるのではなく,初めからReceiverとSenderを混ぜた状態で凝集させることができる。ex.)Photoswitch etc... by tashiro

Experiments

Sender Assay

Purpose

  • 調べるthe absolute number of senders required to activate pLux.
  • 調べる the difference in synthesis ability among Strains.
  • 調べるwhether does it change or not when the AHL precursur, methionine, is added. Right we show the AHL synthesis pathway.

Procedure and result

c.f.Improving Sender

1.Senderは少なくとも5x10^4は必要である。
2.Senderの株によってLuxIの活性が違う。